Mit dem JTAG ICE können alle AVR Microcontroller mit JTAG Schnittstelle programmiert werden. Zur Fehlersuche in Programmen kann mit dem JTAG ICE das Programm im Einzelschritt durchlaufen werden. Man
kann sich die Register oder Inhalte von Variablen anschauen, kann
Haltepunkte setzen ( bis zu 3 Stück ) und kann den Programmablauf
verfolgen. Ein unentbehrliches Hilfsmittel für den AVR Programmierer.
Unterstützt wird das AVR-Studio aber auch die freien Tools wie avrdude und gdb.